細胞は主要組織適合抗原複合体（MHC）を発現し、その先端に自己の目印となるペプチドが結合し細胞の表面に発現されている。

　このペプチドの構造をキラーT細胞が見分けることで、非自己の細胞を認識し、ウイルス感染細胞やがん細胞、臓器移植された組織に対し拒絶反応を起こす。