莢膜をもつ細菌としてはブドウ球菌、緑膿菌、肺炎桿菌、炭疽菌、インフルエンザ菌、髄膜炎菌、肺炎連鎖球菌、百日咳菌などが知られている。

　一方、何を莢膜というのか明確でないころがあり、特にグラム陰性 菌は、外膜のO側鎖が長くなったのと莢膜との区別が困難とされている。