初期に使われていた培地はほとんどが液体培地であった。液体培地は雑菌の混入した際にそれが分かりにくいという欠点があった。

　寒天培地は、雑菌が混入すると培地の表面にコロニーが発生するため、その部分だけを除去したり、実験対象の菌だけを別の培地に移せるなどのメリットが多く今では最もポピュラーな培地となった。